Секвенаторы PPSQ являются частью ВЭЖХ системы Shimadzu по определению аминокислотных последовательностей белков и пептидов.  Принцип действия секвенаторов PPSQ  основан на обработке исследуемого пептида определенным набором реагентов, в результате которой происходит отщепление одной аминокислоты с N-конца последовательности в виде фенилтиогидантоинового производного (реакция Эдмана).

В ходе реакции Эдмана аминокислоты отщепляются по порядку от N-конца белка путем многократного проведения деградации по Эдману и дериватизируются. В результате продуцируются стабильные ПТГ-аминокислоты.

Идентификацию фенилтиогидантоиновых производных производят с помощью жидкостного хроматографа.

Преимущества использования деградации по Эдману для секвенирования аминокислот:

• Гарантированная N-концевая последовательность белков;
• Не требуется предварительная обработка образцов;
• Дифференциация изобарных аминокислот (лейцин и изолейцин);
• Возможна идентификация даже по неизвестным белкам, не зарегистрированным в базах данных
• Соответствие FDA 21 CFR Часть 11

Соответствие FDA 21 CFR Часть 11

Программное обеспечение LabSolutions PPSQ обеспечивает соответствие рекомендациям FDA 21 CFR Part 11 и обеспечивает соответствие требованиям безопасности, управления пользователями и контрольному журналу, установленным FDA 21 CFR Part 11.

1. Безопасность

Пользователи управляются на основе групп, при этом каждый пользователь распознается по имени пользователя и паролю. Уникальные группы могут быть созданы путем включения лиц с разными правами доступа. Четкое определение прав доступа каждого пользователя предотвращает несанкционированные изменения настроек, работы прибора и доступа к данным.

2. Управление пользователями

Администрирование пользователей LabSolutions включает настройку групп прав и назначение прав пользователям, как в Windows. Права доступа, необходимые для каждого пользователя, могут быть установлены путем назначения различных уровней доступа каждому пользователю. Это помогает обеспечить эффективное администрирование пользователей и более эффективную работу лаборатории.

3. Контрольный журнал

Регистрируются входы в систему и выход из нее, изменения в пользователях и группах, а также начало и завершение сбора данных вместе с именем пользователя и временем. Записанный оперативный журнал может быть зарегистрирован в базе данных для обеспечения прослеживаемости.

4. Проверка программного обеспечения

Целостность программ, составляющих систему, и необработанных данных, полученных с помощью приборов, может быть проверена, что обеспечивает надежность системы и данных. Результатами этих проверок изменений можно управлять в виде распечаток. Объединение пиков хроматограммы, печать и другие процессы могут выполняться для каждого образца.

• Калибрует время удерживания ПТГ-аминокислот.
• Время удерживания можно редактировать, просто выбрав ПТГ-аминокислоту и щелкнув пик.
• Автоматически создает отчет, содержащий аналитические параметры, расчетные последовательности, нормы урожайности и другую информацию.

Автоматическая оценка последовательности. Последовательности автоматически оцениваются после завершения анализа каждого цикла. Отображается до четырех аминокислот-кандидатов вместе с их уровнями достоверности.

Настраиваемые отчеты.  Отчеты, содержащие такую ​​информацию, как аналитические параметры, расчетные последовательности и нормы урожайности, создаются автоматически.

Отображение графика доходности

Начальная и повторная нормы доходности рассчитываются и отображаются в виде графика. Аминокислоты, используемые для расчетов, можно выбирать произвольно.

Состав. Используя деградацию по Эдману, система дериватизирует аминокислоты белка в порядке от N-концов, расщепляет производные и, исходя из времен удерживания этих расщепленных производных ВЭЖХ, идентифицирует аминокислоты.

Технические характеристики:

Изократическая система

Белковые секвенаторы серии PPSQ изократически разделяют ПТГ-аминокислоты. Это улучшает базовую стабильность и позволяет проводить высокочувствительный анализ ПТГ-аминокислот.

Изократический анализ последовательности обеспечивает более стабильное время удерживания. Пики, обнаруженные в предыдущих циклах, могут быть отменены с помощью обработки хроматограммы подстанции, что упрощает идентификацию последовательностей.

Выполнение анализа ПТГ-аминокислот в изократическом режиме, в котором элюенты рециркулируют, чтобы позволить многократное использование подвижной фазы, позволяет сократить жидкие отходы и эксплуатационные расходы.

Система градиента

Высокочувствительный анализ

Высокочувствительная проточная кювета обеспечивает высокочувствительное обнаружение ПТГ-аминокислот, что позволяет проводить последовательный анализ с использованием следовых проб.

Эта система обладает высокой стабильностью анализа, поскольку она оснащена высокопроизводительным детектором и насосом для подачи растворителя, который обеспечивает отличную производительность перекачивания даже в диапазоне микропотока, что в совокупности обеспечивает высокую стабильность анализа. Поскольку можно получить хроматограммы с хорошей воспроизводимостью, пики, обнаруженные в предыдущем цикле, могут быть отменены путем выполнения обработки дифференциальной хроматограммы. Это позволяет легко идентифицировать ПТГ-аминокислоты даже в следовых пробах.

Стандартные конфигурации

Изократическая система

Система градиента 

Требования к месту установки:

Материалы для скачивания

Секвенаторы белков по Эдману PPSQ-51A / 53A (Листовка ЛФ)

Градиентная система PPSQ-51A / 53A (Брошюра, англ.)

Рекомендации Shimadzu для биофармацевтики