Описание

Автоматическая система для анализа размера ДНК / РНК с оптимизированными наборами реагентов. Позволяет проводить качественный (определение размера) и количественный анализ продуктов полимеразной цепной реакции, фрагментов рестрикции ДНК, синтетических олигонуклеотидов; определение уровня экспрессии генов, идентификацию и количественный анализ транскриптов, контроль качества синтезированной in vitro матричной РНК, контроль чистоты выделенной РНК и т.п.

Система электрофореза с микрочипом для анализа ДНК / РНК может быстро идентифицировать виды мяса.

Применение системы MCE ™ -202 MultiNA позволяет существенно снизить стоимость одного анализа по сравнению со стоимостью традиционных анализов методом электрофореза в агарозном геле или методом капиллярного электрофореза.

Конструкция и материал микрочипа позволяют использовать его для нескольких тысяч анализов (~ 3600), при этом используется крайне незначительное количество расходных материалов. С использованием одного микрочипа полный цикл анализа ДНК составляет около 4 мин.

Для увеличения производительности в прибор может быть установлено до четырех микрочипов для параллельной работы. В этом случае время одного анализа сокращается до 75 секунд.

Оптимальная конфигурация капилляров микрочипа и специально подобранный состав буферного раствора обеспечивают превосходные характеристики электрофоретического разделения нуклеиновых кислот. Благодаря малой длине электрофоретического канала и его оптимальной форме достигается непревзойденная на сегодняшний день скорость электрофоретического разделения.

Флуориметрический детектор с фотоумножителем и источником возбуждения флуоресценции на основе светодиода обеспечивает примерно 10-кратное увеличение чувствительности по сравнению с традиционным окрашиванием бромистым этидием. Используемые флуоресцентные красители, такие как SYBRgreen II и SYBRgold, абсолютно безвредны для здоровья в отличие от традиционного бромистого этидия.

Оптимизированные наборы реагентов (четыре типа для анализа ДНК разного размера и один тип для анализа РНК), обеспечивают высокое разрешение и высокую чувствительность, например, для проверки мутаций при редактировании генома и определении генотипа.

Внутренние маркеры молекулярного веса уже включены в наборы реагентов и используются при каждом анализе. Одновременный электрофорез внутреннего маркера обеспечивает высокую надежность и воспроизводимость анализа.

Благодаря автоматизированной системе пробоподготовки количество ручных операций сведено к минимуму. График анализа может включать до 120 проб, прибор может принимать до 108 проб (96 + 12 дополнительных). Скорость обработки анализа - 255 с при использовании одного микрочипа; 75 с при использовании четырех микрочипов; (время начальной и конечной промывки микрочипа не включено).

Технические характеристики

Штативы для образцов	96 пробирок для ПЦР (2 мл); 1x96-луночный планшет для ПЦР; 8 стрипов на 12 пробирок для ПЦР; 12 стрипов на 8 пробирок для ПЦР; (+12 дополнительных ячеек для установки пробирок с образцами)
Минимальный объем образца	5 мкл в режиме смешивания реагентов на микрочипе; 6 мкл при предварительном смешивании с реагентами
Микрочип	Кварцевый, электрофоретической канал длиной 23 мм, интегрированные платиновые электроды. Может быть одновременно установлено до 4 микрочипов
Предварительная обработка	Автоматический ввод образца в микрочип, автоматическое заполнение электрофоретического канала буферным раствором, автоматическая промывка микрочипа до и после измерения
Прикладываемое напряжение	До 1,5 кВ; максимальный ток 250 мкА
Время анализа	255 с при использовании одного микрочипа; 75 с при использовании четырех микрочипов; (Время, необходимое для начальной и конечной промывки микрочипа не включено)
Детектирование	Флуоресцентный детектор с источником возбуждения флуоресценции при помощи светодиода (470 нм)
Диапазон измерения размеров нуклеиновых кислот	25–500 нг (набор DNA-500); 100–1000 нг (набор DNA-1000); 100–2500 нг (набор DNA-2500); До 28S rRNA (~5,0 knt) (Набор RNA)
Разрешение	5 нг (25 – 100 нг); 5% (100 – 500 нг); 10% (500 – 1000 нг); 20% (1000 – 2500 нг)
Точность определения размера нуклеиновых кислот	± 5 нг (25 – 100 нг); ± 5% (100 – 500 нг); ± 15% (DNA-100, DNA-2500)
Максимально возможная концентрация соли в образце	Анализ ДНК: 10 мМ Tris-HCl + 125 мМ NaCl или KCl; Анализ РНК: 10 мМ Tris-HCl + 1 мМ EDTA
Предел обнаружения	Анализ ДНК: 0,2 нг/мкл (в 10 мМ Tris-HCl + 50 мМ KCl + 1,5 мМ MgCl2); Анализ РНК: 5 нг/мкл (общая РНК), 25 нг/мкл (матричная РНК в 10 мМ Tris-HCl + 1 мМ EDTA)
Диапазон измеряемых концентраций	Анализ ДНК: 0,5–50 нг/мкл (в 10 мМ Tris-HCl + 50 мМ KCl + 1,5 мМ MgCl2); Анализ РНК: 25–500 нг/мкл (общая РНК), 25–250 нг/мкл (матричная РНК в 10 мМ Tris-HCl +1 мМ EDTA)
Точность определения концентрации	Анализ ДНК: ± 30% (в 10 мМ Tris-HCl + 50 мМ KCl + 1,5 мМ MgCl2)
Воспроизводимость определения концентрации	Анализ РНК: коэффициент вариации ~ 20%
Размеры	415 x 545 x 508 мм (Ш x Г x В)
Вес	43 кг

Работа системы электрофореза на многоразовых микрочипах MCE ® -202 MultiNA полностью отличается от техники электрофореза в агарозном геле, и от работы систем одноразовыми системами электрофореза с одноразовыми микрочипами.

Маркеры размера автоматически корректируют результаты электрофореза для автоматического предсказания и количественного определения размера. Пользователи могут выполнять автоматический или ручной повторный анализ своих данных.

Программное обеспечение

Программное обеспечение с дружественным интерфейсом и большим количеством функций максимально упрощает проведение исследования. Оператору достаточно загрузить образцы и реагенты в прибор, задать в программе желаемую последовательность анализа образцов и кликнуть по иконке «Старт» на экране компьютера. Все остальное, включая обработку электрофореграмм, прибор выполнит в автоматическом режиме. Каждый этап анализа наглядно отображается на экране компьютера. Результаты анализов могут быть легко экспортированы в формат .csv для последующей обработки при помощи стороннего программного обеспечения.

Средство просмотра позволяет параллельно отображать данные анализа за разное время и дату. Электрофореграмма разделения отображается в реальном времени анализа. Даже во время текущего анализа возможен просмотр уже полученных результатов анализа завершенных образцов.

Предоставляются расширенные функции эксплуатации и технического обслуживания, включая функции проверки производительности анализа.

Постоянно доступны: список графика анализа и дисплей состояния чипа.

Начните анализ всего за три шага

Чрезвычайно простое управление. После создания алгоритма анализа просто загрузите образцы и реагенты и нажмите кнопку «Пуск».

Зарегистрируйте алгоритм анализа.

Единый алгоритм анализа позволяет проводить анализ с использованием нескольких наборов реагентов.

Загрузите образцы и реагенты

Отображение результатов анализа

Проверка качества прямого секвенирования ПЦР

Прямое секвенирование ПЦР - это метод, при котором вместо клонирования продуктов амплификации, полученных в результате реакции ПЦР, они используются непосредственно в качестве матрицы для определения последовательности оснований. Это очень эффективный метод, поскольку он позволяет быстро получить информацию о базовой последовательности и снижает влияние ошибок захвата базы после клонирования.

Однако эти результаты могут сильно различаться в зависимости от ситуации амплификации после ПЦР. Чтобы увеличить этот показатель успеха, необходимо проверить чистоту (качество и количество) продуктов ПЦР до реакции секвенирования. Эта проверка традиционно проводилась с помощью электрофореза в агарозном геле.

Бывают случаи, когда данные о последовательности, полученные при анализе последовательности, указывают на возможность наличия близкородственных субстратов для реакции, даже если оказывается, что существует только один целевой продукт ПЦР. Одна из возможных причин этого - ограниченная чувствительность электрофореза в агарозном геле. С помощью этого метода трудно выяснить наличие следовых количеств побочных продуктов реакции ПЦР среди основных продуктов реакции.

С помощью MultiNA концентрацию можно рассчитать по площади пика на электрофореграмме. Этого значения достаточно для использования в последовательной реакции. Таким образом, MultiNA чрезвычайно полезен для проведения анализов чистоты продуктов ПЦР в качестве важного компонента процесса прямого секвенирования ПЦР.

Материалы для скачивания

Система электрофореза на микрочипах для анализа ДНК / РНК MCE ™ -202 MultiNA (Брошюра ЛФ, рус.)

Система электрофореза на микрочипах для анализа ДНК / РНК MCE ™ -202 MultiNA (Брошюра Shimadzu, англ)

MultiNA Detection of Circular Plasmid DNA

MultiNA Detection of Multi-Base Mutation by Genome Editing

MultiNA Identification of Common Bean Cultivars by RAPD-STS

MultiNA Идентификация аллергенов в пищевых продуктах